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重大疾病，如恶性肿瘤、心脑血管疾病、感染性疾病、神经精神病、创伤和消化系统疾病等一直是医学研究的方向与重点。另外，机体正常结构、功能（健康状态）的维持与调节机制也是未来医学研究的重要方面。
建国以来，我国医学发展举世瞩目，平均预期寿命已从35岁增至69岁。自50年代以来，从沙眼病毒分离到针刺镇痛，从多型肝炎病毒克隆到疾病基因组学研究，无一不浸透着我国基础医学工作者的心血。但不可否认，我国医学研究距国际先进水平还有差距。随着发达国家在本领域投入不断加大，这种差距可能还会加大。
前沿与学科发展优先领域
（一）肿瘤、心脑血管病等重大疾病发生发展及其干预措施的分子与细胞机制
1、重要功能基因与重大疾病相关基因结构、功能与表达调控的研究；
2、重大疾病相关的蛋白质组学和蛋白、多防结构与功能的研究；
3、生物信息学、基因芯片、基因治疗及组织工程等高新技术在重大疾病诊断、治疗中的应用；
4、干细胞（胚胎干细胞、造血干细胞神经干细胞等）的建系及分化。
（二）神经、免疫、内分泌调节系统在健康状态维持与疾病发生发展中的作用
5、神经损伤与功能紊乱的病理机理及干预措施；
6、神经退行性疾病病因学与诊断、治疗技术区；
7、重要免疫细胞发育分化及其在免疫耐受与免疫应答调节中的作用；
8、新型免疫调节分子的发现及功能研究：
9、神经-内分泌-免疫调节网络失调与疾病的关系。
（三）自然与社会因素对健康的影响及其致病机
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